(這部份的內容摘錄自Torssell所著天然物化學教科書：Torssell, K.B.G. "Natural Product Chemistry---a mechanistic and biosynthetic approach to secondary metabolism", John Wiley & Sons,1983.)
天然物的生合成包含下列三大路徑：
詳列如下圖(藍字為重要中間產物，紅色為最終產物)：
最上方所列是光合作用及其逆反應呼吸作用，光合作用產生單醣 (monosaccharides)，是所有事件的開端，其他反應所得產物如箭頭所示。
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上述三大路徑之名稱來由，即三種重要的中間產物，分別是 shikimic acid、polyketide 及 mevalonic acid。紅字所示的最終目的物包括生命必需物質：醣類 (polysaccharides)，經由單醣 (monosaccharides)轉變而來；蛋白質 (peptides)，經由 shikimic acid 及乙酸 (acetic acid) 合成；脂肪 (fats)，得自 polyketides。
至於其他類型天然物，帖類 (terpenoids) 得自 mevalonic acid，脂肪酸 (fatty acids)得自 polyketides，黃酮類 (flavonoids) 及部份芳香族化合物 (aromatics) 來自 shikimic acid及 polyketides，香豆素 (coumarins) 來自 shikimic acid，生物鹼 (alkaloids) 來自 shikimic acid 及乙酸。
上回提到 tirucallol 是檸檬類素 (limonoid) 的「前身」，這兒列出其生合成步驟如下 (從 tirucallol 到 parent skeleten)：
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這裡所列只是梗概，若要再追根究底的話，其中不但還包括數不盡的酵素，再往上推，連基因都會牽涉進來，研究透徹的話，天然物的來源就不只是合成或萃取，還可用基因工程來大量生產。19991019
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